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實(shí)時(shí)熒光定量PCR在甲流感診斷中的作用

發(fā)布日期: 2009-11-06
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摘要:病原檢測(cè)方法及儀器是人感染豬流感防控的關(guān)鍵環(huán)節(jié),針對(duì)實(shí)時(shí)熒光定量PCR分子診斷核酸檢測(cè)技術(shù)的性以及國(guó)產(chǎn)試劑和儀器的成熟性,本文分析了該技術(shù)在以往禽流感檢測(cè)被采用的國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)以及使用的廣泛性,后介紹了發(fā)布的美國(guó)CDC《針對(duì)人感染豬流感病毒治療和預(yù)防的臨時(shí)指南》和我國(guó)衛(wèi)生部《人感染豬流感預(yù)防控制技術(shù)指南(試行)》,兩部法規(guī)都將實(shí)時(shí)熒光定量PCR確定為人感染豬流感實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)的確診方法。從以上情況可以獲知:實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在人感染豬流感診斷中具有、快速、成熟、合法的特點(diǎn),是一種法定的主流技術(shù),將來(lái)實(shí)施中,國(guó)產(chǎn)化儀器和試劑都有保障。
關(guān)鍵詞:人感染豬流感  豬流感診斷  快速檢測(cè)  實(shí)時(shí)定量PCR  Real-time RT-PCR
性的人感染豬流感公共衛(wèi)生事件發(fā)展勢(shì)頭迅猛,發(fā)生國(guó)家眾多,衛(wèi)生組織29日晚已將流感大流行警告級(jí)別從4級(jí)提高到5級(jí),我國(guó)也于28日召開(kāi)了國(guó)務(wù)院常務(wù)會(huì)議對(duì)防控進(jìn)行了部署。現(xiàn)在已進(jìn)入關(guān)鍵的防控措施落實(shí)階段,其中檢測(cè)與診斷技術(shù)至關(guān)重要。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在以往禽流感診斷中的應(yīng)用
*,雖雖然本次人感染豬流感事件的病毒基因序列還在進(jìn)一步確立當(dāng)中,但本次疫情病原學(xué)基礎(chǔ)明確,屬于RNA病毒感染性疾病?;仡櫧陙?lái)感染RNA病毒的烈性傳染病,如SARS、禽流感,衛(wèi)生組織及我國(guó)衛(wèi)生行政和技術(shù)部門相繼制定了較為成熟的實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)和診斷標(biāo)準(zhǔn),其中我國(guó)頒布的應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)和快速診斷的標(biāo)準(zhǔn)如《GB/T 19438.1—2004禽流感病毒通用熒光RT—PCR檢測(cè)方法》、《GB/T 19438.2—2004 H5亞型禽流感病毒熒光RT—PCR檢測(cè)方法》、《GB/T 19438.3—2004 H7亞型禽流感病毒熒光RT—PCR檢測(cè)方法》等,同時(shí)我們也注意到近年來(lái)國(guó)家針對(duì)食品安全尤其是乳品檢測(cè)和食物致病菌檢測(cè)的實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn),如《SN/T 1632.3-2005 奶粉中阪崎腸桿菌檢驗(yàn)方法:熒光PCR方法》和《SN/T 1870-2007 食品中致病菌檢測(cè)方法:實(shí)時(shí)PCR法》。以上實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在禽流感及其它方面檢測(cè)的國(guó)家標(biāo)準(zhǔn)是該技術(shù)在當(dāng)前的人感染豬流感診斷中應(yīng)用的基礎(chǔ)和前提。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)及在我國(guó)衛(wèi)生應(yīng)急中的應(yīng)用要求   
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)(Real-time quantitative Polymerase Chain Reaction簡(jiǎn)稱Real Time PCR,如果用于RNA檢測(cè),這被稱為逆轉(zhuǎn)錄實(shí)時(shí)PCR即Real-time RT-PCR)是實(shí)時(shí)PCR法,它是指對(duì)DNA或經(jīng)過(guò)反轉(zhuǎn)入(RT-PCR)的RNA通過(guò)聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)并實(shí)時(shí)監(jiān)測(cè)DNA的放大過(guò)程,在擴(kuò)增的指數(shù)增就測(cè)量擴(kuò)增產(chǎn)物,因?yàn)閿U(kuò)增指數(shù)增測(cè)量值與特異DNA(RNA)起始量存在相關(guān)性,從而實(shí)現(xiàn)定量檢測(cè)。Real Time PCR的基本目標(biāo)是測(cè)量和鑒別非常微量的特異性核酸,從而可通過(guò)監(jiān)測(cè)CT值而實(shí)現(xiàn)對(duì)原始目標(biāo)基因的含量定量。目前被普遍使用的多種常規(guī)PCR方法如各種凝膠電泳PCR法,終點(diǎn)熒光定量法或PCR-ELISA法叫做終點(diǎn)PCR法。實(shí)時(shí)熒光定量PCR法大的優(yōu)點(diǎn)是克服了終點(diǎn)PCR法進(jìn)入平臺(tái)期或叫飽和期后定量的較大誤差,實(shí)現(xiàn)DNA/RNA的定量。普通PCR技術(shù)發(fā)明于1983年,而實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)發(fā)明于上世紀(jì)九十年代并于1996年生產(chǎn)出了上*臺(tái)實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀,實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)得以實(shí)現(xiàn)的技術(shù)要素主要有熒光定量PCR試劑盒和實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀,我國(guó)熒光定量PCR試劑盒研發(fā)實(shí)力強(qiáng)大,較多,臨床診斷的品種如HBV/HCV及禽流感診斷試劑盒性能優(yōu)良、供應(yīng)充足,基本實(shí)現(xiàn)國(guó)產(chǎn)化。在豬流感病毒RNA核酸序列明確的情況下,利用現(xiàn)有的試劑研發(fā)平臺(tái),人感染豬流感實(shí)時(shí)熒光定量PCR診斷試劑盒很快就會(huì)面世。實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀由于技術(shù)含量高,只有少數(shù)幾家中國(guó)企業(yè)有能力生產(chǎn)如西安天隆科技有限公司生產(chǎn)的TL-988系列儀器不但取得了發(fā)明、國(guó)家科學(xué)技術(shù)獎(jiǎng)、國(guó)家重點(diǎn)新產(chǎn)品、醫(yī)療器械注冊(cè)證,而且被國(guó)家發(fā)改委確立為國(guó)家高技術(shù)產(chǎn)業(yè)化示范工程2008年生物醫(yī)學(xué)工程專項(xiàng),產(chǎn)品性能達(dá)到水平,在乳品檢測(cè)行業(yè)*比進(jìn)口儀器還高[1-3]。實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀應(yīng)用廣泛,1999年開(kāi)始,西方發(fā)達(dá)國(guó)家嘗試將PCR應(yīng)用于臨床傳染病診斷、食品安全檢測(cè)以及血液篩查,目前已相當(dāng)普及。2008年12月13日中國(guó)衛(wèi)生部下發(fā)《衛(wèi)生應(yīng)急隊(duì)伍裝備參考目錄》(衛(wèi)辦應(yīng)急發(fā)[2008]207號(hào)),其中要求縣級(jí)以上衛(wèi)生應(yīng)急隊(duì)伍建設(shè)中必須配備PCR儀和實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀作為傳染病控制類裝備。
實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)在豬流感診斷中的作用已有法規(guī)確立
在人感染豬流感病毒出現(xiàn)以前,針對(duì)豬與豬傳染的傳統(tǒng)豬流感疫情,近年來(lái)我國(guó)科技人員經(jīng)過(guò)不懈努力,探索快速檢測(cè)與診斷方法,發(fā)表了一系列應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)的研究論文[4-5]。
人感染豬流感疫情發(fā)生后,美國(guó)疾病預(yù)防控制中心(CDC)于2009年4月28日發(fā)布了針對(duì)人感染豬流感病毒治療和預(yù)防臨時(shí)指南,西安天隆科技有限公司在*時(shí)間將其翻譯成中文版本[6]。其中規(guī)定了確診病例的診斷方法:具有急性發(fā)燒呼吸道疾病的臨床癥狀并且經(jīng)實(shí)時(shí)熒光定量PCR (real-time RT-PCR)或病毒分離培養(yǎng) (viral culture)實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)方法檢驗(yàn)證實(shí)感染A(H1N1)型豬流感病毒。衛(wèi)生部辦公廳于4月30日印發(fā)了《人感染豬流感預(yù)防控制技術(shù)指南(試行)》的通知》[7],其中在實(shí)驗(yàn)室檢測(cè)和病例診斷報(bào)告章節(jié),內(nèi)容如下:
檢測(cè)程序
呼吸道標(biāo)本應(yīng)首先應(yīng)用real time RT-PCR方法檢測(cè)A型流感病毒的M基因、Swine( H1N1)的HA基因和NP基因,以及質(zhì)控對(duì)照RNP基因。同時(shí),接種MDCK細(xì)胞或SPF雞胚進(jìn)行病毒分離,并測(cè)定病毒的全基因組序列。
 檢測(cè)方法
用Real-time RT-PCR方法檢測(cè)豬流行性感冒( H1N1病毒)病毒。
 其他檢測(cè)方法 
快速流感抗原檢測(cè)
病毒培養(yǎng)
免疫熒光法(或裝配的IFA )
顯然,上述衛(wèi)生部法規(guī)中,與“其他檢測(cè)方法”不同,實(shí)時(shí)熒光定量PCR方法被法定為人感染豬流感診斷的檢測(cè)方法。
參考文獻(xiàn):
1. Nian-cai Peng(彭年才), Chun-lin Wang ,Li-li Zhang ,Miao-lin Lu ,Zhen-xi Zhang: Asymmetric PCR method in generation of HBV ssDNA for pyrosequencing, Academic Journal of Xi’an Jiaotong University,VOL.21 ,Feb 2009,54-56
2. 彭年才,張鎮(zhèn)西,李明:乳制品中阪崎腸桿菌的快速檢測(cè),食品安全導(dǎo)刊,08.7:96-100
3. 彭年才,蘇明權(quán),張鎮(zhèn)西:乳品檢測(cè)中實(shí)時(shí)熒光定量PCR儀的研制,中國(guó)乳品工業(yè),200705:62-64
4. 段廷云,陳紅英,崔保安等:實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測(cè)H1N1亞型豬流感病毒,畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào),2008。39(6):752-756
5. 張春明,喬傳玲,陳艷等,豬流感病毒M基因?qū)崟r(shí)熒光定量PCR診斷方法的建立,中國(guó)預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報(bào),2008。20(10):805-809
6. 美國(guó)CDC針對(duì)人感染豬流感病毒治療和預(yù)防的臨時(shí)指南(中英文全文)
7.中國(guó)衛(wèi)生部:人感染豬流感預(yù)防控制技術(shù)指南(試行)
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